瑕疵担保は、設備の欠陥（瑕疵）に対する補修義務です。EPC契約では、引渡後一定期間の瑕疵担保が標準で、蓄電所では10年以上が一般的です。

瑕疵担保期間中の故障・性能未達は、EPC事業者の負担で修理・交換が行われます。事業者の財務体力が、長期保証履行の前提となります。